Et intercitytog på vej mod Berlin bliver afsporet under dramatiske omstændigheder nær Vordingborg. Fem civile passagerer og to politibetjente mister livet i ulykken.
Mens Havarikommissionen arbejder på at finde årsagen til katastrofen, opsøges kommissionschefen af en mystisk kvinde, som kræver, at efterforskningen bliver indstillet – mens det stadig er muligt.
Konrad Simonsen og hans efterforskningsteam bliver herefter sat på sagen, der hurtigt viser sig at være langt mere kompleks end en almindelig togulykke. Sporene fører til russiske olieinteresser, en lille dansk natradiostation, en gruppe passionerede amatørarkæologer og et lukket internetfællesskab med mørke hemmeligheder.
Mirakelbarnet er niende bind i Lotte og Søren Hammers populære krimiserie om chefkriminalinspektør Konrad Simonsen og hans team.