En oktoberaften i 2018 låser Theis sig ind i sit nye hus på Møn. Han har ingen interesse i at møde mennesker; hans ønske er at skrive, pleje haven og finde ro på sin egen grund under stjernerne. Han fordyber sig i research til en ny roman og læser om europæisk middelalder, terrorisme og forsvundne charterturister. Musene gnaver i væggene, og løbebillerne tager bolig i huset. Måske er det en mår, der larmer på loftet om natten. Imens distancerer han sig mere og mere fra omverdenen. Er han ved at miste forstanden, eller er det samfundet, der er ved at falde fra hinanden?
Da han møder Josefine, opstår en ny og magisk forbindelse til verden. Men Theis aner ikke, at han allerede, dag for dag, er ved at ødelægge sig selv.
Habitat er en fortælling om sindets, begærets og civilisationens mørke kræfter – og om at finde kærlighed og håb på den anden side af undergangen.